突发,Claude攻克生物学「40年未解难题」!狂筛150亿条序列,发现者亲自验收
困扰科学界40年的问题,AI只用4个月就解出来了。Anthropic宣布其生物学研究团队与Claude合作,成功绘制出全球首个细菌源Vault(囊泡样蛋白颗粒)的三维结构图。整个项目耗时不到4个月,包括90分钟颗粒分离、34小时生成首个完整结构模型,约一周完成最终结构图谱。Vault颗粒发现者之一Leonard Rome作为付费顾问参与项目,认为研究提供了重要新数据,并提出细菌、噬菌体和人类细胞中的Vault究竟承担相同功能还是演化出不同功能的新问题。

Vault颗粒1986年首次被发现,是细胞中最大的蛋白质组装结构之一,其结构和功能困扰科学界40余年。此前Vault仅在动物和植物等复杂生物细胞中发现,虽在细菌和噬菌体基因组中找到远缘同源序列,但是否能组装成Vault颗粒未获实验验证。团队利用AI分析约150亿条预测蛋白质序列,挑选44个序列实验测试,Claude将候选蛋白序列转化为适合大肠杆菌表达的DNA构建设计并协助优化分离纯化流程。最终15种候选蛋白产生可溶性蛋白,7种组装成Vault样颗粒,4种经冷冻电镜确认具有Vault结构。

技术报告显示,噬菌体Vault比人源Vault更短,但因形状更接近球形,内部容积反而大约25%。团队通过增加蛋白质内部重复结构单元扩大纳米容器尺寸,改造后颗粒内部容积比原始L05 Vault增加约20%,比人源Vault大约50%。该成果为功能研究提供新实验模型,对制药领域尤其是递送技术意义重大。Vault是天然蛋白质纳米容器,此前研究尝试用哺乳动物Vault包裹酶、小分子药物、mRNA等用于肿瘤药物递送和疫苗开发,但生产和纯化困难;能在大肠杆菌中表达生产的Vault有望开发为易生产、尺寸可调的纳米递送新载体。Anthropic也指出Claude犯了不少错误,如推荐含干扰DNA转染组分的培养基导致项目延误两周,冷冻电镜处理时跳过标准步骤生成镜像混淆的错误结构模型。团队强调研究人员需不断纠正Claude并反馈实验记录以改进模型。

今年四月,Anthropic以4亿美元股权收购成立八个月、员工不足十人的AI制药初创Coefficient Bio,杀入AI制药。不到一年,其布局覆盖模型层(Claude负责思考)、软件层(Claude Science串联60多个科学数据库)、硬件层(MHS让Claude指挥机械臂、传感器、分析仪器并反馈调整实验数据),成为生命科学领域兼具工具供应商、合作伙伴和自主药物发现三重身份的角色。10至11月,Anthropic自研设计出蝎毒蛋白结合剂,向抗蛇毒药物研发迈进一步,Vault也是完全自研成果;收购一人药企Mithril Medicine,同日公布Claude在六家合作机构的实测结果,覆盖做药几乎每个环节;将五月启动的AI for Science计划扩大到20家科研机构和基金会,允许科研人员为单个项目申请最高5万美元Claude使用额度,已开放超过1万个免费或优惠科研席位。
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