英伟达点名的杭州团队,补上AI科研最后一公里
AI for Science的竞争,正在向科研闭环延伸。
以蛋白设计为例,蛋白模型虽越来越强,但真正设计一个分子,研究人员仍需查文献、找结构、下载权重、配置环境,再将计算任务送上服务器。模型给出结果后,还要换工具看结构、做筛选,判断哪些候选值得继续。一次计算跑完,下一步从哪里开始,往往仍靠人把各环节接起来。
如今,这些隐藏在模型前后的工作,开始被AI公司重新审视。今年4月,OpenAI推出面向生命科学的GPT-Rosalind;6月,Anthropic发布Claude Science;8月,Anthropic又公布Agent参与蛋白质设计、衔接外部实验验证的研究。这些进展指向同一变化:AI不再只负责模型本身的计算,也开始参与模型前后的研究工作,能分析结果、调整方案、继续推进任务。

国内已有团队走到类似交叉路口。杭州AI蛋白质设计公司力文所近日发布Lévin™ Harness,面向科研社区开放使用。它把数据、模型、插件工具、算力和工作流放进同一个Agent工作区,由研究人员定义目标、方法和关键决策,Agent据此推进计算、分析结果,再根据反馈调整下一轮方案。
在Lévin™ Harness中,用户可选择专业科学模型和分析工具完成蛋白质结构预测、序列设计等任务,但平台本身不绑定特定模型,通用模型层保持开放。新模型和科学能力可通过插件继续加入,任何人都能为自己的模型制作专属插件。一套研究方法跑通后,还可沉淀为Workflow,用于重复运行和修改。其核心职责,就是把模型、工具、算力和研究过程组织到同一条工作链上。
这解决的正是AI for Science当下比单次推理复杂得多的问题:如何让智能真正进入科研现场,并持续工作下去。

Lévin™ Harness是一款以Agent为核心的蛋白质设计应用,可近似理解为专门服务生命科学研究的Agent工作台。研究者可在同一工作台提出目标、查看分子结构、组织计算,并在结果出现后修改方案,前一步信息能继续供后一步使用。Agent依靠通用大模型(DeepSeek、Kimi、GLM、Qwen、小米MiMo等开放模型)理解需求、规划步骤,再调用工具执行任务;专门训练的科学模型和分析工具承担蛋白质结构预测、序列设计等计算。Harness负责连接这些能力与数据、算力,并保留研究过程。研究人员只需负责科学目标、方法和关键决策,随时可审阅结果、补充条件或纠正方向。
以蛋白binder设计为例,传统流程需研究人员明确靶点、结合位置和目的,再给模型提约束、生成候选、筛选分子。在Harness里,研究人员可提出针对某靶点设计binder的目标,由Agent参与靶点调研、整理信息、辅助分析结合位置,研究者再确定方法和约束。由于binder能否与靶点形成合适界面,与残基空间关系直接相关,力文所在Agent工作区内置三维分子可视化工具,屏幕上的分子结构信息及操作可直接转化为Agent上下文,让对话指向明确研究对象。研究者说“这里”,Agent也能理解具体空间位置。
有了判断依据,下一步是把设计思路落实为计算。Agent会根据任务意图自行选择AlphaFold、ProteinMPNN、Pallatom、RFantibody等专业工具。但工具多了,使用本身也产生工作量。Lévin™ Harness通过定制插件系统,把专业能力接入同一环境,自动完成下载、安装和调用,Agent再选择工具、配置参数、串联计算。用户还可通过插件加入新模型和能力。计算资源同样接入工作链,可连接本地工作站或提交远程GPU服务器,完成后由Agent分析产物、推进后续步骤。

一轮计算结束,研究通常还没完成。若候选未满足约束,研究人员仍需判断问题所在。这就需要Workflow,把能力组织成可执行、可修改的研究方法。研究者确定科学方法和关键决策,Agent协助连接、运行与调试,再根据结果参与调整。候选进入实验后,整理好的实验结果也可返回项目,成为下一轮设计依据。实验操作仍由实验团队完成,Harness承接的是研究人员、计算工具与反馈之间的协作。随着多轮调整,经过验证的工具组合、参数和检查步骤能留在Workflow中,供类似任务复用。
Lévin™ Harness的产品思路,始终围绕科研任务怎样继续推进,让不同环节围绕研究目标接续起来,形成科研闭环。目前,该产品已面向科研社区开放使用,支持搭载Apple芯片的Mac。
力文所成立于2021年9月,名字来自Levinthal悖论:蛋白理论构象数量极其庞大,随机尝试寻找天然结构耗时可能远超宇宙年龄,但自然界蛋白质却能在极短时间内完成折叠。公司最初目标就是成为通用型蛋白质设计公司,面向不同分子和应用提供设计能力。创始人兼CEO王浩博拥有北京大学博士、哈佛大学博士后背景,师从蛋白质AI学者Sergey Ovchinnikov,研究横跨有机化学、结构生物学、生物信息学和人工智能。团队也带有强跨学科特征,汇集计算机科学、结构生物学、化学知识和真实实验能力。早期,力文所搭建Lésign智能化蛋白设计平台,随后把技术重心推进到全原子蛋白质生成,最具代表性的工作是自研全原子蛋白质生成模型Pallatom。
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